Badania nasze dotyczą wczesnych etapów embriogenezy u roślin. Modelami na których prowadzimy również nasze badania są żeńskie i męskie komórki linii płciowej i dotyczą dwóch zagadnień:
- organizacji chromatyny komórek linii płciowej i podczas wczesnych etapów embriogenezy u roślin kwiatowych
- epigenetyczna regulacja ekspresji genów w komórkach linii płciowej i podczas wczesnych etapów embriogenezy u roślin kwiatowych, w tym biogeneza i metabolizm mikro RNA.
Zespół badawczy:
prof. dr hab. Elżbieta Bednarska-Kozakiewicz
dr hab. Katarzyna Niedojadło, prof. UMK
mgr Roma Smolińska, asystent
mgr Marlena Kozłowska, były doktorant
mgr Michał Świdziński
Prowadzone przez nas badania zmierzają do poznania epigenetycznych mechanizmów włączonych w regulację ekspresji genów w komórkach linii płciowej oraz produktach podwójnego zapłodnienia u roślin okrytonasiennych. Materiał badawczy stanowią komórki różnicującego się i dojrzałego gametofitu żeńskiego oraz męskiego a także zapłodnione woreczki zalążkowe dwóch modelowych gatunków – Hyacinthus orientalis (jednoliścienne) i Arabidopsis thaliana (dwuliścienne). Z naszych wcześniejszych badań wiemy, że podczas rozwoju żeńskich i męskich gamet komórki te różnią się nie tylko strukturą chromatyny ale także charakteryzuje je odmienna aktywność transkrypcyjna. Obserwujemy także różną pozapłodnieniową aktywność zygoty i pierwotnej komórki bielmowej. Dlatego też prowadzone obecnie badania skoncentrowane są na poznaniu:
- organizacji chromatyny komórek męskiego gametofitu oraz niezapłodnionego i zapłodnionego woreczka zalążkowego, w tym szczególnie komórek uczestniczących w podwójnym zapłodnieniu,
- epigenetycznych procesów włączonych w regulację ekspresji genów badanych komórek na tle zmian ich aktywności transkrypcyjnej,
- biogenezy i metabolizmu mikro RNA w komórkach linii płciowej.
Finansowane projekty badawcze:
Grant NCN nr 2011/03/D/NZ3/00603 (2012 – 2016)
Analiza ekspresji i dystrybucji mikro RNA w komórkach męskiego i żeńskiego gametofitu przed i po zapłodnieniu u roślin okrytozalążkowych.
Kierownik: dr Katarzyna Niedojadło
Grant MNiSW nr N N303 290434 (2008 – 2011)
Dynamika transkrypcji i dystrybucja elementów systemu splicingowego podczas płciowego rozmnażania roślin kwiatowych.
Kierownik: prof. dr hab. Elżbieta Bednarska